Наиболее частыми причинами различных пороков развития головного мозга являются неправильная закладка нервной системы или поражение ее в период эмбрионального развития вследствие изменений генетической информации (см. Генетика), некоторых инфекций, перенесенных матерью в период беременности (токсоплазмоз, краснуха, грипп, инфекционный гепатит), радиации, травм, а также в результате вредного воздействия некоторых химических веществ. Различают следующие дефекты развития головного мозга.